团队负责人

李宏，理学博士，副教授，博士生导师。主持国家自然科学基金2项、海南省自然科学基金2项。目前主要从事病原菌致病和耐药机制的解析，以及微生物中关键生物活性肽的挖掘。以第一作者或通讯作者发表SCI论文12篇，其中中科院二区以上论文9篇。以第一发明人授权国家发明专利3项。主讲本科生《生物信息学》和研究生《基因组学与生物信息学》课程。2023年参加第六届全国高校青年教师教学竞赛获理科组三等奖。2024年指导本科生参加第九届全国大学生生命科学竞赛（创新创业类）获一等奖，第九届全国大学生生命科学竞赛（科学探究类）获二等奖。担任Frontiers in Cellular and Infection Microbiology期刊客座主编，BMC Genomics、BMC Microbiology等期刊审稿人。

团队介绍

本团队致力于探究病原菌的致病和耐药机制，同时挖掘治疗疾病的关键生物活性肽，为建设健康海南和生态海南提供科学依据和技术支撑。具体包括：开发机器学习模型，从全基因组水平挖掘病原菌的毒力因子、效应蛋白和耐药基因；综合应用转录组学、代谢组学、蛋白质组学等多组学技术和实验手段，以毒力因子和效应蛋白为主要研究对象，深入解析病原菌的致病机制；综合应用比较基因组学和宏基因组学，以耐药基因的SNP位点和水平基因转移为切入点，深入解析病原菌的耐药机制；开发机器学习模型，从宏基因组数据中挖掘关键生物活性肽以预防和治疗慢性炎症性疾病。

主要研究方向

1. 解析病原菌的致病和耐药机制

2. 挖掘用于疾病治疗的生物活性肽

近五年主要研究成果

学术论文

1. Zhao, H., Ma, J., Tang, Y., Ma, X., Li, J., Li, H.*, and Liu, Z.* Genome-wide DNA N6-methyladenosine in Aeromonas veronii and Helicobacter pylori. BMC Genomics, 2024, 25(1):161.

2. Ma, J., Zhao, H., Mo, S., Li, J., Ma, X., Tang, Y., Li, H.*, and Liu, Z.*. Acquisition of Type I methyltransferase via horizontal gene transfer increases the drug resistance of Aeromonas veronii. Microbial Genomics, 2023, 9(9): 001107.

3. Li, H., Ma, X., Tang, Y., Wang, D., Zhang, Z., and Liu Z.* Network-based analysis of virulence factors for uncovering Aeromonas veronii pathogenesis. BMC Microbiology, 2021, 21: 188.

4. Li, H., Ma, X., Tang, Y., Yan, C., Hu, X., Huang, X., Lin, M., and Liu Z.* Integrated analysis reveals an association between the rhizosphere microbiome and root rot of arecanut palm. Pedosphere, 2021, 31(5): 725-735.

5. Li, H., Jiang, S., Li, C., Liu, L., Lin, Z., He, H., Deng, X.W., Zhang, Z.*, and Wang, X.* The hybrid protein interactome contributes to rice heterosis as epistatic effects. Plant Journal, 2020, 102: 116-128.

6. Yang, X., Yang, S., Qi, H., Wang, T., Li, H.*, and Zhang, Z.* PlaPPISite: a comprehensive resource for plant protein-protein interaction sites. BMC Plant Biology, 2020, 20: 61.

获批专利

1. 李宏，曹欣，刘柱，陈银华，马香，王丹，唐燕琼，高玉晓，胡新文。耐硼赖氨酸芽孢杆菌在抑制火龙果软腐病菌生长方面的应用。专利号：ZL202111280400.9，授权公告日：2023年02月03日。

2. 李宏，高玉晓，刘柱，马香，唐燕琼，晏承梁，雷军霞，林敏。一种耐硼赖氨酸芽孢杆菌作为底盘细胞制备的槟榔根腐病杀菌剂。专利号：ZL201910963026.9，授权公告日：2022年12月02日。

3. 李宏，徐一轲，刘柱，马香，唐燕琼，盛强龙，孙愉宸。一种维氏气单胞菌减毒菌株的构建方法、菌株及其应用。专利号：ZL201910841507.2，授权公告日：2021年09月21日。

在研科研项目

1. 李宏主持，整合多组学数据探究I型限制修饰系统的进化历史和调控毒力的分子机制，国家自然科学基金，2025/01-2028/12，32万元，32460244。

2. 李宏主持，基于多组学分析探索维氏气单胞菌毒力蛋白动态相互作用的分子机制，国家自然科学基金，2021/01-2024/12，35万元，32060153。

3. 李宏主持，耐硼赖氨酸芽孢杆菌对罗非鱼的促生作用及机制研究，海南省自然科学基金，2022/04-2025/03，10万元，322RC589。

4. 李宏主持，维氏气单胞菌毒力因子的挖掘及侵染宿主机制的分析，海南省自然科学基金，2019/03-2021/12，8万元，319QN161。

代表性成果介绍

1. 病原菌毒力因子的挖掘与分析

图1 毒力因子预测模型pLM4VF的开发流程

图2 毒力因子富集的两个网络模块

图3 毒力相关基因hsdM和hsdS的水平基因转移

2. 微生物组与植物之间的相互作用

图4 植物蛋白质复合体结构数据库的构建流程

图5 健康和根腐槟榔根际土壤中微生物群落的比较